會計電算化系統舞弊出現的原因主要如下：
1、會計軟體的缺陷。目前市場上有數百種會計軟體，有些單位使用獨立開發的軟體，各軟體水平參差不齊。一些企業使用的軟體安全性與保密性上存在著諸多的問題和不足，使得舞弊者有機可乘。
2、企業內部控制制度的缺陷。實施會計電算化，需建立與之相配套的一系列內部控制制度加以約束，才能充分發揮電算化的優勢。目前，不少單位無嚴密的管理制度或有章不循，使得會計電算化不能正常健康運轉。由於內部控制制度薄弱，操作人員可能超越許可權或未經授權的人員有可能通過計算機和網路瀏覽全部資料檔案，篡改、複製、偽造、銷燬企業重要的資料，以達到個人目的。
