公积金贷款利率全国都是一样的，也就是全国范围以内首次使用公积金贷款买房的利率都是3.25%，比起商业贷款是很有优势的，尤其是在北京、深圳等屋价较高的城市，公积金贷款可以省下一定的成本，即便是贷款额度有限制的情况下。
1、贷款利率有差别。商业贷款五年以上的基准利率是4.9%，公积金贷款五年以上的基准利率是3.25%。
2、贷款比例有差别。一般情况下，同一套房子，商业贷款可以贷7成，而纯公积金贷款可以贷到8成。
3、审核流程不同。商业贷款是在过户之前审核贷款，而公积金贷款是在办理过户之后再审核贷款。
4、审批时间不同。商业贷款审批需要20个工作日左右，公积金贷款审批需要40个工作日左右，商业贷款快于公积金贷款。
5、贷款来源不同。商业贷款放款源头主要是商业银行等一些房贷机构筹集的社会公众资金，而公积金贷款则是公积金缴存者缴纳的资金。
6、使用人群不同。商业贷款是给众人符合贷款条件的人开放的，而公积金贷款只有公积金缴存者才可以享受。
7、利息用途不同。商业贷款的利息是商业银行的盈利，归相关的投资人，而公积金贷款的利息是政府规定用途，只能用于保障性住屋建设。
8、审批机构不同。商业贷款审核只要是银行决定，决定权在银行，而公积金贷款的审批是公积金管理中心，决定权在公积金中心，而银行只是执行机构。
9、年限和额度不同。不同城市不同银行的规定是不一样的，但是总的来说商业贷款的贷款年限和额度一般要高于公积金贷款。
10、二套房贷款额度不同。商业贷款对二套房的政策性限制更多，利率更高，而公积金贷款则基本不受二套房贷的政策影响，同样享受优惠政策。
